Los árboles se trasplantas cuando van a brotar. En el caso del pino lo harías cuando despierte del descanso invernal. No sé como será el caso del Pino patula, pues estás en otra región. Un árbol enfermo no se suele trasplantar porque podrías sentenciarle, y más tratándose de un pino. Si el árbol está mejor, yo esperaría a que esté bien de salud para el trasplante. Si ves que es una urgencia absluta, hazlo, trasplantalo a un sustrato que sea más drenante y asegúrate de que conservas parte del sustrato antiguo y sus micorrizas (polvito blanco, como moho, muy beneficioso para el árbol). No le machaques mucho las raíces porque podrías matarlo.
Si durante el trasplante encuentras pudrición de raíces, trata de eliminar la parte podrida.
Tenlo en un lugar resguardado de las inclemencias meteorológicas hasta que veas que el árbol se ha asentado y ha empezado a moverse.
Mucha suerte. Si es posible, podrías adjuntar alguna foto del pino? Quizás al verlo descubramos que sea otro el problema y una cuestión de riego inadecuado.
Un saludo, y espero que se recupere tu magnífico ejemplar